El proyecto del Museo contempló la restauración de la residencia de la familia Braun Menéndez, construida entre 1903 y 1906. El diseño estuvo a cargo del arquitecto francés Antoine Beaulier, quien también proyectó otros importantes inmuebles de la ciudad, como la cárcel y el cuartel de policía, el batallón de Magallanes, entre otros. Además de exhibiciones temporales, el Museo alberga importantes colecciones de mobiliario y objetos que representan la época de oro de Magallanes, las que se exhiben en sus Salones de Época, así como una renovada Exhibición Histórica que da cuenta del proceso de poblamiento humano en el territorio austral hasta la consolidación de la ciudad.