Al igual que la Biblioteca de Santiago, el Archivo se ubica en los almacenes de la Dirección de Aprovisionamiento del Estado – DAE (1928-1945). Se crea debido al notable incremento de documentación durante el siglo pasado, el marco del aumento de la complejidad social, los nuevos soportes y tipos de información, y del crecimiento de la administración del Estado. Originalmente fue nombrado como Archivo del Siglo XX, en 1997 cambio por la de Archivo Nacional de la Administración. Este Archivo dispone de un acervo que mayoritariamente corresponde a documentos creados durante los siglos XX y XXI. Por decreto del 2006, los documentos conservados en este Archivo juntos con los conservados en el Archivo Nacional Histórico y Archivo Regional de La Araucanía fueron declarados Monumento Histórico Mueble.